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來自于匈牙利的團隊使用了一種創新的基于拉曼光譜的監控系統,用于設計動態補料策略,使中國倉鼠卵巢細胞(CHO)培養中關鍵細胞營養物質維持在理想水平。針對葡萄糖、乳酸和16個單個氨基酸建立的偏最小二乘校準模型具有很好的預測能力,均方根誤差值低,平方相關系數高。所開發的用于實時測量營養物質和副產品濃度的模型,使研究人員能夠更好地了解細胞的代謝行為和營養物質的消耗。
為了細胞建立更有益的營養環境,結合拉曼模型(葡萄糖和精氨酸)的預測,采用了兩種動態補料策略來控制兩部分多組分(two-part multi-component )培養基的添加。因此,營養物質能(葡萄糖和氨基酸)保持在相對穩定的水平,而不是高波動,這為細胞提供了一個更平衡的環境。此外,與葡萄糖動態補料培養相比,基于氨基酸的補料控制可以防止營養物質過量,并顯著減少培養基的供給,具有經濟效益。
2材料
2.1細胞系
使用表達阿達木單抗(Abbvie)的CHO-DG44細胞系進行細胞培養實驗。
2.2反應器與條件
生物反應器培養實驗在2L工作體積的Applikon玻璃生物反應器中進行,目標初始密度為5×105個細胞mL-1。使用Ez控制系統(Applikon Biotechnology)在所需設定點控制以下工藝參數:攪拌速度(120 rpm)、溫度(37℃)、DO(40%)和pH(7.1)。利用BioXpert軟件,通過局域網連接,每10 min采集一次培養參數。
2.3拉曼光譜收集
在細胞培養過程中,使用Kaiser raman RXN2 Hybrid system收集拉曼光譜,使用不銹鋼浸沒式MR探頭通過光纖收集拉曼信號,拉曼探頭在高壓滅菌培養前與生物反應器一起進行滅菌。光譜采集范圍為200-1890cm?1,分辨率為1cm?1。采集的系統設置為75次曝光次數,曝光時間為10秒。生物反應器覆蓋鋁箔以保護其免受光。
2.4模型處理
利用化學計量學工具分析拉曼監測過程中生成的大型多維數據集,并提取相關的過程信息。采用PLS回歸方法,通過將拉曼光譜(作為獨立的X變量)與其對應的離線測量參考濃度(作為因Y變量)聯系起來,建立了葡萄糖、乳酸和氨基酸組分的校準模型。
2.5補料
在生物反應器中添加補料溶液以補充細胞的營養物質:兩部分多組分補料培養基(ActiCHO Feed A and Feed B,GE Healthcare)和400 g L-1葡萄糖(Sigma-Aldrich)原液。
2.6兩種補料策略
采用兩種基于葡萄糖和精氨酸的動態補料策略,使細胞的營養物質保持在所需的濃度。在以葡萄糖為基礎的動態補料實驗中,基于拉曼監測的葡萄糖濃度(GLC)來控制營養補充。如果GLC低于11 mM的設定值,則使用兩部分多組分補料培養基(Feed A和Feed B)進行補料,以將葡萄糖限制在11 mM的低水平。除此之外,不需要額外的葡萄糖。因此,雙組分飼料培養基中所含的所有營養成分都按指示劑葡萄糖的比例添加。
在基于氨基酸的動態補料實驗中,補料策略是基于拉曼監測的GLC和精氨酸濃度(ARG)調整三種料液的補加(Feed A和Feed B和單獨的葡萄糖原液)。目的是將ARG水平維持在2.5 mM的設定值,同時將葡萄糖限制在11 mM的低水平。
2.7PLS模型
圖1:PLS模型用于校準(灰色圓圈)和驗證點(紅色菱形)輸出的預測與測量的葡萄糖(A)和乳酸(B)濃度值的圖
為了研究拉曼模型的預測性能,研究人員采用了一個獨立的生物反應器培養實驗作為驗證運行。圖1A和B顯示了離線測量的葡萄糖和乳酸濃度與拉曼預測濃度,其中灰色圓圈為校準,紅色菱形為驗證樣品。兩種拉曼模型都能準確估計葡萄糖和乳酸的低RMSEP值分別為1.64和4.51 mM,高r2值分別為0.986和0.998,效果較為理想。
圖2:在PLS回歸過程中,拉曼預測和離線測量數據之間的相關性:丙氨酸(A)、精氨酸(B)、苯丙氨酸(C)和纈氨酸(D)。校準數據集用灰色圓圈表示,測試數據集用紅色菱形表示
表2:20種氨基酸成分構建的偏最小二乘模型的性能(用于校準、交叉驗證和預測)
研究人員建立了ALA、ARG、ASP、ILE、LEU、PHE、GLU、THR、VAL和LYS的最佳模型,其中平均RMSEC和RMSECV誤差值分別為用于校準的濃度范圍平均值的8 ± 1%和10 ± 1%。這些PLS模型的一些預測能力的例子如圖2A-D所示。可以看到,數據點(灰色圓圈)圍繞著理想的1:1線,這意味著模型提供的拉曼預測接近參考濃度測量值。
3結果
葡萄糖的動態補料:基于拉曼監測GLC水平自動控制多組分補料培養基(補料A和補料B)
拉曼的過程控制在培養第4天(第93小時)前不久開始。此后,通過連續添加補料A(補料B培養基為補料A體積的1/10),將GLC保持在所需的低水平(11 mM),持續4天。在整個生物反應器運行過程中,為細胞總共補加了大約240 mL的補料A和24 mL的補料B。然而,由于使用多組分補料培養基將GLC調整到所需的水平,所有其他組分都根據兩種培養基的化學計量組成按葡萄糖比例供應。這種方法的主要缺點是可能會過度補料其他營養物質。
基于氨基酸的動態補料培養實驗:ARG(A)和GLC (B)的拉曼在線監測和營養物質補料的自動控制。多組分補料培養基(補料A和補料B)的添加,同時提供濃縮葡萄糖原液以避免葡萄糖耗盡。
其目標是將葡萄糖和額外的關鍵營養物質保持在一個可接受的濃度范圍內,從而確保細胞處于一個平衡的培養環境。ARG和GLC的設定點分別為2.5mM和11 mM。此外,研究人員還設定了一個葡萄糖的上限(15 mM),以避免過量,因為補料A培養基中含有500 mM的葡萄糖。
在實驗后期,觀察到ARG模型預測的誤差略有增加(圖4A)。因此,ARG保持在低于期望的2.5 mM的較低水平,這表明未來需要進一步的模型優化。相比之下,GLC在目標點11 mM左右(在9到13mM之間)發生變化(圖4B)。比較提供的多組分飼料培養基的累積體積,在氨基酸動態補料實驗中,分別補加了100 mL Feed A和10 mL Feed B,不到葡萄糖動態補料實驗的一半。此外,當所提供的補料A培養基不能將GLC水平提高到11 mM時,向反應器中添加單獨的葡萄糖原液(2220 mM)。在整個培養實驗中,添加37 mL葡萄糖原液和100 mL補料A培養基后,總共需要132 mmol葡萄糖來維持所需的GLC水平。因此,側面證明了當使用基于葡萄糖的補料策略調整添加培養基時,部分營養物質存在過量添加的情況。
4結論
兩種動態補料培養的細胞密度(A)、活力(B)和產物滴度(C)
基于拉曼技術開發的兩種控制策略,很好地完成了對目標參數的監控和閉環補料控制。其中,采用基于葡萄糖的動態飼養策略,可以將葡萄糖濃度限制在一個恒定的低水平,但補料培養基中的其他營養物質含量在培養結束時會過量并積累。相比之下,新開發的精氨酸補料策略可以有效地將氨基酸和葡萄糖的濃度控制在一個狹窄的范圍內,從而為細胞建立一個更穩定的生長環境。比較兩種補料策略對培養性能的影響,兩種策略在細胞密度、活力和產生的抗體濃度方面的結果相似。但是,與基于葡萄糖的動態補料策略相比,基于精氨酸的動態補料策略可以顯著減少(一半以上)添加的累積量,減少了培養過程中培養基的使用量,提高了生產效率。
Domján, J., Pantea, E., Gyürkés, M., Madarász, L., Kozák, D., Farkas, A., Horváth, B., Benk?, Z., Nagy, Z.K., Marosi, G. & Hirsch, E. 2022, "Real‐time amino acid and glucose monitoring system for the automatic control of nutrient feeding in CHO cell culture using Raman spectroscopy", Biotechnology journal, vol. 17, no. 5, pp. e2100395-n/a.